Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tvp23bQ9D8T4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tvp23bQ9D8T4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms