Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lin37Q9D8N6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lin37Q9D8N6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms