Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D8N1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D8N1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D8N1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D8N1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D8N1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D8N1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D8N1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D8N1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D8N1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9D8N1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D8N1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D8N1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D8N1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D8N1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D8N1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D8N1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D8N1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D8N1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D8N1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D8N1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D8N1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D8N1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D8N1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D8N1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D8N1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D8N1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D8N1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9D8N1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q9D8N1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q9D8N1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D8N1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D8N1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D8N1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D8N1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D8N1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D8N1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9D8N1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.4 ms