Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chmp4bQ9D8B3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chmp4bQ9D8B3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chmp4bQ9D8B3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chmp4bQ9D8B3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chmp4bQ9D8B3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chmp4bQ9D8B3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chmp4bQ9D8B3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chmp4bQ9D8B3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chmp4bQ9D8B3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Chmp4bQ9D8B3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chmp4bQ9D8B3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chmp4bQ9D8B3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chmp4bQ9D8B3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chmp4bQ9D8B3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chmp4bQ9D8B3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Chmp4bQ9D8B3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Chmp4bQ9D8B3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chmp4bQ9D8B3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chmp4bQ9D8B3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chmp4bQ9D8B3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chmp4bQ9D8B3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chmp4bQ9D8B3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chmp4bQ9D8B3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chmp4bQ9D8B3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chmp4bQ9D8B3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chmp4bQ9D8B3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chmp4bQ9D8B3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chmp4bQ9D8B3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chmp4bQ9D8B3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chmp4bQ9D8B3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Chmp4bQ9D8B3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chmp4bQ9D8B3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chmp4bQ9D8B3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chmp4bQ9D8B3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chmp4bQ9D8B3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chmp4bQ9D8B3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Chmp4bQ9D8B3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chmp4bQ9D8B3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chmp4bQ9D8B3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chmp4bQ9D8B3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chmp4bQ9D8B3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chmp4bQ9D8B3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chmp4bQ9D8B3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Chmp4bQ9D8B3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms