Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
U2af1Q9D883 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
U2af1Q9D883 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
U2af1Q9D883 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
U2af1Q9D883 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
U2af1Q9D883 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
U2af1Q9D883 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
U2af1Q9D883 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
U2af1Q9D883 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
U2af1Q9D883 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
U2af1Q9D883 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
U2af1Q9D883 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
U2af1Q9D883 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
U2af1Q9D883 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
U2af1Q9D883 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
U2af1Q9D883 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
U2af1Q9D883 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
U2af1Q9D883 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
U2af1Q9D883 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
U2af1Q9D883 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
U2af1Q9D883 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
U2af1Q9D883 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
U2af1Q9D883 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
U2af1Q9D883 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
U2af1Q9D883 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
U2af1Q9D883 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
U2af1Q9D883 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
U2af1Q9D883 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
U2af1Q9D883 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
U2af1Q9D883 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
U2af1Q9D883 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
U2af1Q9D883 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
U2af1Q9D883 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
U2af1Q9D883 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
U2af1Q9D883 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
U2af1Q9D883 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
U2af1Q9D883 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
U2af1Q9D883 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms