Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capns2Q9D7J7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms