Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Srp19Q9D7A6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms