Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MsraQ9D6Y7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MsraQ9D6Y7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MsraQ9D6Y7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms