Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubxn11Q9D572 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ubxn11Q9D572 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ubxn11Q9D572 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms