Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrameQ9D4Z5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PrameQ9D4Z5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms