Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Y3

Rhox2a, Reproductive homeobox 2A, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2aQ9D4Y3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rhox2aQ9D4Y3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox2aQ9D4Y3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhox2aQ9D4Y3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhox2aQ9D4Y3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhox2aQ9D4Y3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhox2aQ9D4Y3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhox2aQ9D4Y3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhox2aQ9D4Y3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhox2aQ9D4Y3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhox2aQ9D4Y3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhox2aQ9D4Y3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhox2aQ9D4Y3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhox2aQ9D4Y3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhox2aQ9D4Y3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhox2aQ9D4Y3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhox2aQ9D4Y3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhox2aQ9D4Y3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhox2aQ9D4Y3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhox2aQ9D4Y3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhox2aQ9D4Y3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhox2aQ9D4Y3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhox2aQ9D4Y3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhox2aQ9D4Y3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.5 ms