Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D4W2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D4W2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D4W2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D4W2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D4W2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D4W2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D4W2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Q9D4W2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D4W2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D4W2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D4W2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D4W2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D4W2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D4W2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D4W2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D4W2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D4W2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D4W2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D4W2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D4W2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D4W2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D4W2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D4W2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D4W2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D4W2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D4W2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D4W2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D4W2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D4W2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D4W2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D4W2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D4W2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D4W2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D4W2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D4W2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D4W2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D4W2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D4W2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D4W2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D4W2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D4W2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms