Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S6

Erich6b, Glutamate-rich 6B, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich6bQ9D4S6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Erich6bQ9D4S6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Erich6bQ9D4S6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Erich6bQ9D4S6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Erich6bQ9D4S6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Erich6bQ9D4S6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Erich6bQ9D4S6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Erich6bQ9D4S6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Erich6bQ9D4S6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Erich6bQ9D4S6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Erich6bQ9D4S6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Erich6bQ9D4S6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Erich6bQ9D4S6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Erich6bQ9D4S6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Erich6bQ9D4S6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Erich6bQ9D4S6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Erich6bQ9D4S6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Erich6bQ9D4S6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Erich6bQ9D4S6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Erich6bQ9D4S6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Erich6bQ9D4S6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Erich6bQ9D4S6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Erich6bQ9D4S6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Erich6bQ9D4S6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Erich6bQ9D4S6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Erich6bQ9D4S6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Erich6bQ9D4S6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Erich6bQ9D4S6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Erich6bQ9D4S6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Erich6bQ9D4S6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Erich6bQ9D4S6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Erich6bQ9D4S6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Erich6bQ9D4S6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Erich6bQ9D4S6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Erich6bQ9D4S6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms