Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf6Q9D4J7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phf6Q9D4J7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf6Q9D4J7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms