Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pabpc6Q9D4E6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pabpc6Q9D4E6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms