Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D3

4933402D24Rik, MCG113882, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402D24RikQ9D4D3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933402D24RikQ9D4D3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933402D24RikQ9D4D3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933402D24RikQ9D4D3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933402D24RikQ9D4D3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933402D24RikQ9D4D3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933402D24RikQ9D4D3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933402D24RikQ9D4D3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
4933402D24RikQ9D4D3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933402D24RikQ9D4D3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933402D24RikQ9D4D3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933402D24RikQ9D4D3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933402D24RikQ9D4D3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933402D24RikQ9D4D3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933402D24RikQ9D4D3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933402D24RikQ9D4D3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933402D24RikQ9D4D3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933402D24RikQ9D4D3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933402D24RikQ9D4D3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933402D24RikQ9D4D3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933402D24RikQ9D4D3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4933402D24RikQ9D4D3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4933402D24RikQ9D4D3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4933402D24RikQ9D4D3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms