Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
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Krt20Q9D312 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt20Q9D312 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt20Q9D312 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt20Q9D312 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt20Q9D312 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt20Q9D312 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt20Q9D312 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt20Q9D312 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt20Q9D312 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt20Q9D312 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt20Q9D312 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt20Q9D312 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt20Q9D312 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt20Q9D312 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt20Q9D312 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt20Q9D312 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt20Q9D312 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt20Q9D312 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt20Q9D312 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt20Q9D312 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt20Q9D312 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt20Q9D312 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt20Q9D312 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt20Q9D312 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt20Q9D312 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt20Q9D312 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt20Q9D312 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt20Q9D312 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt20Q9D312 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt20Q9D312 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt20Q9D312 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt20Q9D312 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Krt20Q9D312 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Krt20Q9D312 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Krt20Q9D312 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt20Q9D312 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Krt20Q9D312 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Krt20Q9D312 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Krt20Q9D312 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt20Q9D312 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt20Q9D312 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt20Q9D312 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Krt20Q9D312 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Krt20Q9D312 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt20Q9D312 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt20Q9D312 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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Krt20Q9D312 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt20Q9D312 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Krt20Q9D312 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt20Q9D312 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt20Q9D312 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt20Q9D312 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt20Q9D312 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt20Q9D312 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Krt20Q9D312 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt20Q9D312 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt20Q9D312 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt20Q9D312 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt20Q9D312 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt20Q9D312 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt20Q9D312 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt20Q9D312 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt20Q9D312 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt20Q9D312 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt20Q9D312 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt20Q9D312 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt20Q9D312 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt20Q9D312 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt20Q9D312 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt20Q9D312 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt20Q9D312 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt20Q9D312 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt20Q9D312 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt20Q9D312 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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