Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2D9

Klhdc8b, Kelch domain-containing protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc8bQ9D2D9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhdc8bQ9D2D9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhdc8bQ9D2D9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhdc8bQ9D2D9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhdc8bQ9D2D9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhdc8bQ9D2D9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhdc8bQ9D2D9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhdc8bQ9D2D9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhdc8bQ9D2D9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhdc8bQ9D2D9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhdc8bQ9D2D9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhdc8bQ9D2D9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhdc8bQ9D2D9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhdc8bQ9D2D9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Klhdc8bQ9D2D9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Klhdc8bQ9D2D9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhdc8bQ9D2D9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms