Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Batf3Q9D275 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Batf3Q9D275 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms