Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F5

Mrnip, MRN complex-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MrnipQ9D1F5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MrnipQ9D1F5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
MrnipQ9D1F5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MrnipQ9D1F5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms