Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Susd3Q9D176 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Susd3Q9D176 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Susd3Q9D176 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms