Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M2

Cdca7, Cell division cycle-associated protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca7Q9D0M2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdca7Q9D0M2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdca7Q9D0M2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdca7Q9D0M2 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdca7Q9D0M2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdca7Q9D0M2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdca7Q9D0M2 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdca7Q9D0M2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdca7Q9D0M2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdca7Q9D0M2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdca7Q9D0M2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdca7Q9D0M2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdca7Q9D0M2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cdca7Q9D0M2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdca7Q9D0M2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdca7Q9D0M2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdca7Q9D0M2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdca7Q9D0M2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdca7Q9D0M2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdca7Q9D0M2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdca7Q9D0M2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdca7Q9D0M2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdca7Q9D0M2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdca7Q9D0M2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdca7Q9D0M2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdca7Q9D0M2 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdca7Q9D0M2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdca7Q9D0M2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdca7Q9D0M2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdca7Q9D0M2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdca7Q9D0M2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdca7Q9D0M2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdca7Q9D0M2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdca7Q9D0M2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdca7Q9D0M2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdca7Q9D0M2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms