Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Mms19Q9D071 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mms19Q9D071 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mms19Q9D071 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mms19Q9D071 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mms19Q9D071 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mms19Q9D071 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mms19Q9D071 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mms19Q9D071 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mms19Q9D071 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mms19Q9D071 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mms19Q9D071 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mms19Q9D071 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mms19Q9D071 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mms19Q9D071 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Mms19Q9D071 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mms19Q9D071 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mms19Q9D071 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Mms19Q9D071 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mms19Q9D071 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mms19Q9D071 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mms19Q9D071 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Mms19Q9D071 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mms19Q9D071 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mms19Q9D071 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mms19Q9D071 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mms19Q9D071 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Mms19Q9D071 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Mms19Q9D071 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Mms19Q9D071 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Mms19Q9D071 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Mms19Q9D071 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mms19Q9D071 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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Mms19Q9D071 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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Mms19Q9D071 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mms19Q9D071 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mms19Q9D071 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Mms19Q9D071 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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Mms19Q9D071 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mms19Q9D071 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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Mms19Q9D071 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mms19Q9D071 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mms19Q9D071 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mms19Q9D071 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mms19Q9D071 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mms19Q9D071 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mms19Q9D071 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mms19Q9D071 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mms19Q9D071 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mms19Q9D071 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mms19Q9D071 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mms19Q9D071 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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Mms19Q9D071 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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