Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab3bQ9CZT8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab3bQ9CZT8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms