Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cmss1Q9CZT6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmss1Q9CZT6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms