Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ9

Dnajc18, DnaJ homolog subfamily C member 18, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc18Q9CZJ9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnajc18Q9CZJ9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnajc18Q9CZJ9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnajc18Q9CZJ9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnajc18Q9CZJ9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnajc18Q9CZJ9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnajc18Q9CZJ9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnajc18Q9CZJ9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnajc18Q9CZJ9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnajc18Q9CZJ9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnajc18Q9CZJ9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnajc18Q9CZJ9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnajc18Q9CZJ9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnajc18Q9CZJ9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnajc18Q9CZJ9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnajc18Q9CZJ9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnajc18Q9CZJ9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnajc18Q9CZJ9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnajc18Q9CZJ9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnajc18Q9CZJ9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnajc18Q9CZJ9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnajc18Q9CZJ9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnajc18Q9CZJ9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnajc18Q9CZJ9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnajc18Q9CZJ9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnajc18Q9CZJ9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnajc18Q9CZJ9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnajc18Q9CZJ9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnajc18Q9CZJ9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnajc18Q9CZJ9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnajc18Q9CZJ9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnajc18Q9CZJ9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnajc18Q9CZJ9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnajc18Q9CZJ9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dnajc18Q9CZJ9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dnajc18Q9CZJ9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajc18Q9CZJ9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajc18Q9CZJ9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnajc18Q9CZJ9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms