Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gins3Q9CY94 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gins3Q9CY94 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gins3Q9CY94 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gins3Q9CY94 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gins3Q9CY94 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gins3Q9CY94 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gins3Q9CY94 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gins3Q9CY94 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gins3Q9CY94 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gins3Q9CY94 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gins3Q9CY94 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gins3Q9CY94 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gins3Q9CY94 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gins3Q9CY94 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gins3Q9CY94 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gins3Q9CY94 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gins3Q9CY94 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gins3Q9CY94 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms