Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Mis12Q9CY25 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mis12Q9CY25 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mis12Q9CY25 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms