Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL3

Uncharacterized protein C7orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CXL3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9CXL3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9CXL3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9CXL3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9CXL3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9CXL3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9CXL3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9CXL3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9CXL3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9CXL3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9CXL3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9CXL3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9CXL3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9CXL3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9CXL3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9CXL3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9CXL3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9CXL3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9CXL3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9CXL3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9CXL3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9CXL3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9CXL3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9CXL3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9CXL3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9CXL3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9CXL3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9CXL3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9CXL3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9CXL3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9CXL3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9CXL3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9CXL3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9CXL3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9CXL3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CXL3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q9CXL3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9CXL3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms