Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nip7Q9CXK8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nip7Q9CXK8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nip7Q9CXK8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nip7Q9CXK8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms