Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xrcc3Q9CXE6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xrcc3Q9CXE6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xrcc3Q9CXE6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms