Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx10Q9CWT3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Snx10Q9CWT3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx10Q9CWT3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms