Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWL8

Ctnnbl1, Beta-catenin-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbl1Q9CWL8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnnbl1Q9CWL8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnnbl1Q9CWL8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnnbl1Q9CWL8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnnbl1Q9CWL8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms