Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW03

Smc3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc3Q9CW03 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smc3Q9CW03 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smc3Q9CW03 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smc3Q9CW03 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smc3Q9CW03 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smc3Q9CW03 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smc3Q9CW03 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smc3Q9CW03 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smc3Q9CW03 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smc3Q9CW03 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smc3Q9CW03 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smc3Q9CW03 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smc3Q9CW03 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smc3Q9CW03 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smc3Q9CW03 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smc3Q9CW03 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smc3Q9CW03 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smc3Q9CW03 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smc3Q9CW03 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smc3Q9CW03 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smc3Q9CW03 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smc3Q9CW03 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smc3Q9CW03 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smc3Q9CW03 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smc3Q9CW03 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smc3Q9CW03 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smc3Q9CW03 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smc3Q9CW03 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smc3Q9CW03 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smc3Q9CW03 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smc3Q9CW03 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Smc3Q9CW03 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smc3Q9CW03 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smc3Q9CW03 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smc3Q9CW03 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smc3Q9CW03 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smc3Q9CW03 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smc3Q9CW03 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Smc3Q9CW03 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smc3Q9CW03 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smc3Q9CW03 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smc3Q9CW03 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smc3Q9CW03 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smc3Q9CW03 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smc3Q9CW03 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms