Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atxn3Q9CVD2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atxn3Q9CVD2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms