Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
4930535I16RikQ9CUI2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms