Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CRC3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CRC3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CRC3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CRC3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CRC3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CRC3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms