Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl35Q9CQL6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl35Q9CQL6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl35Q9CQL6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl35Q9CQL6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl35Q9CQL6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl35Q9CQL6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl35Q9CQL6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl35Q9CQL6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl35Q9CQL6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl35Q9CQL6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl35Q9CQL6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl35Q9CQL6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl35Q9CQL6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl35Q9CQL6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl35Q9CQL6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl35Q9CQL6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl35Q9CQL6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl35Q9CQL6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl35Q9CQL6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl35Q9CQL6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl35Q9CQL6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl35Q9CQL6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl35Q9CQL6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl35Q9CQL6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl35Q9CQL6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Mrpl35Q9CQL6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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Mrpl35Q9CQL6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl35Q9CQL6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl35Q9CQL6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl35Q9CQL6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl35Q9CQL6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl35Q9CQL6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl35Q9CQL6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl35Q9CQL6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl35Q9CQL6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl35Q9CQL6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl35Q9CQL6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl35Q9CQL6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl35Q9CQL6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl35Q9CQL6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl35Q9CQL6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl35Q9CQL6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl35Q9CQL6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl35Q9CQL6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl35Q9CQL6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl35Q9CQL6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl35Q9CQL6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl35Q9CQL6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl35Q9CQL6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl35Q9CQL6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl35Q9CQL6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl35Q9CQL6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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