Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL5

Mrpl18, 39S ribosomal protein L18, mitochondrial, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl18Q9CQL5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl18Q9CQL5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Mrpl18Q9CQL5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Mrpl18Q9CQL5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl18Q9CQL5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms