Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL4

Mrpl20, 39S ribosomal protein L20, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl20Q9CQL4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl20Q9CQL4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl20Q9CQL4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl20Q9CQL4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl20Q9CQL4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl20Q9CQL4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl20Q9CQL4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl20Q9CQL4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl20Q9CQL4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl20Q9CQL4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl20Q9CQL4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl20Q9CQL4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl20Q9CQL4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl20Q9CQL4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms