Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccer1Q9CQL2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccer1Q9CQL2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccer1Q9CQL2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms