Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rwdd1Q9CQK7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rwdd1Q9CQK7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rwdd1Q9CQK7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms