Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ndufb9Q9CQJ8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndufb9Q9CQJ8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndufb9Q9CQJ8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms