Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9CQF4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9CQF4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9CQF4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9CQF4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9CQF4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9CQF4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9CQF4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9CQF4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9CQF4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9CQF4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q9CQF4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q9CQF4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q9CQF4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Q9CQF4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q9CQF4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q9CQF4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q9CQF4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q9CQF4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q9CQF4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9CQF4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9CQF4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9CQF4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9CQF4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9CQF4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9CQF4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9CQF4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9CQF4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9CQF4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9CQF4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9CQF4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9CQF4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9CQF4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9CQF4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9CQF4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9CQF4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9CQF4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9CQF4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9CQF4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9CQF4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9CQF4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9CQF4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9CQF4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9CQF4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9CQF4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9CQF4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9CQF4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9CQF4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9CQF4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9CQF4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9CQF4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9CQF4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9CQF4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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