Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTRAFQ9CQE8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTRAFQ9CQE8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms