Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC7

Ndufb4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb4Q9CQC7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb4Q9CQC7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb4Q9CQC7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb4Q9CQC7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb4Q9CQC7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb4Q9CQC7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb4Q9CQC7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb4Q9CQC7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb4Q9CQC7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb4Q9CQC7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb4Q9CQC7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb4Q9CQC7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb4Q9CQC7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb4Q9CQC7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb4Q9CQC7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb4Q9CQC7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb4Q9CQC7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb4Q9CQC7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb4Q9CQC7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb4Q9CQC7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb4Q9CQC7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb4Q9CQC7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb4Q9CQC7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb4Q9CQC7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb4Q9CQC7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb4Q9CQC7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb4Q9CQC7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb4Q9CQC7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ndufb4Q9CQC7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ndufb4Q9CQC7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb4Q9CQC7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb4Q9CQC7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb4Q9CQC7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb4Q9CQC7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb4Q9CQC7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb4Q9CQC7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb4Q9CQC7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb4Q9CQC7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb4Q9CQC7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb4Q9CQC7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb4Q9CQC7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb4Q9CQC7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb4Q9CQC7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb4Q9CQC7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb4Q9CQC7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb4Q9CQC7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb4Q9CQC7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb4Q9CQC7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb4Q9CQC7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb4Q9CQC7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb4Q9CQC7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb4Q9CQC7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb4Q9CQC7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb4Q9CQC7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb4Q9CQC7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb4Q9CQC7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb4Q9CQC7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb4Q9CQC7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb4Q9CQC7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb4Q9CQC7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb4Q9CQC7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb4Q9CQC7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb4Q9CQC7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb4Q9CQC7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb4Q9CQC7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb4Q9CQC7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb4Q9CQC7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufb4Q9CQC7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufb4Q9CQC7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufb4Q9CQC7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb4Q9CQC7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb4Q9CQC7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb4Q9CQC7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb4Q9CQC7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb4Q9CQC7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb4Q9CQC7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb4Q9CQC7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb4Q9CQC7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb4Q9CQC7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb4Q9CQC7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb4Q9CQC7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb4Q9CQC7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb4Q9CQC7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb4Q9CQC7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb4Q9CQC7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb4Q9CQC7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb4Q9CQC7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb4Q9CQC7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb4Q9CQC7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb4Q9CQC7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb4Q9CQC7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb4Q9CQC7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb4Q9CQC7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb4Q9CQC7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb4Q9CQC7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb4Q9CQC7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb4Q9CQC7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb4Q9CQC7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb4Q9CQC7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb4Q9CQC7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms