Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc5Q9CQA1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc5Q9CQA1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc5Q9CQA1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc5Q9CQA1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc5Q9CQA1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc5Q9CQA1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc5Q9CQA1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc5Q9CQA1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc5Q9CQA1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc5Q9CQA1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc5Q9CQA1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc5Q9CQA1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc5Q9CQA1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc5Q9CQA1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc5Q9CQA1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Trappc5Q9CQA1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc5Q9CQA1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc5Q9CQA1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc5Q9CQA1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc5Q9CQA1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc5Q9CQA1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc5Q9CQA1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc5Q9CQA1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc5Q9CQA1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc5Q9CQA1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc5Q9CQA1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc5Q9CQA1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc5Q9CQA1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc5Q9CQA1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc5Q9CQA1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc5Q9CQA1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms