Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnaseh2cQ9CQ18 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms