Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2a1Q99PM3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gtf2a1Q99PM3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2a1Q99PM3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms