Protein–RNA interactions for Protein: Q99PB1

1700020D05Rik, Mage-g2, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700020D05RikQ99PB1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700020D05RikQ99PB1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700020D05RikQ99PB1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
1700020D05RikQ99PB1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700020D05RikQ99PB1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700020D05RikQ99PB1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700020D05RikQ99PB1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700020D05RikQ99PB1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700020D05RikQ99PB1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700020D05RikQ99PB1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700020D05RikQ99PB1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700020D05RikQ99PB1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700020D05RikQ99PB1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700020D05RikQ99PB1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700020D05RikQ99PB1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700020D05RikQ99PB1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700020D05RikQ99PB1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700020D05RikQ99PB1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700020D05RikQ99PB1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
1700020D05RikQ99PB1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700020D05RikQ99PB1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
1700020D05RikQ99PB1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700020D05RikQ99PB1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700020D05RikQ99PB1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms